多肽的溶解性很大程度上取決於多肽的極性。酸性的蛋白溶解於堿性溶液，而堿性蛋白可溶解於酸性溶液，含有大量不帶電荷的極性氨基酸殘基或疏水性氨基酸的疏水性多肽和中性多肽可先溶解於少量有機溶劑中，如DMSO、DMF、醋酸、乙腈、甲醇、丙醇或異丙醇，然後加水（蒸餾水）稀釋。含有甲硫氨酸或半胱氨酸的多肽不能用DMSO溶解，因爲DMSO可能造成側鏈氧化。

多肽溶解測試：在多肽溶解之前先取小部分進行多肽溶解測試，您需要測試幾種不同的溶劑，直到找到适當的一種。超聲處理有助於(yú)打碎顆粒並(bìng)增加溶解度。（注意: 超聲處理會引起溶液發熱和多肽降解。）

将每個酸性氨基酸賦(fù)值爲－1，包括天冬氨酸（D）、谷氨酸（E）、以及羧基末端-COOH。每個堿性氨基酸賦(fù)值爲＋1，包括精氨酸（R）、賴氨酸（K）、組氨酸（H）以及氨基末端-NH2。然後計算整個多肽的電(diàn)荷數。

如果整段肽所帶電荷是陽性的，說明該肽是堿性的。可先嘗試用蒸餾水來溶解；如果不溶於(yú)水，接著(zhe)嘗試用少量10%-25%醋酸溶解，如果仍然失敗的話，添加一些TFA（10-50微升）來增溶，然後用水稀釋至理想濃度。

如果整段肽所帶電荷是陰性的，說明該肽是酸性的。酸性的多肽可以嘗(cháng)試用PBS（PH 7.4）來溶解，如果不溶的話，添加少量的堿性溶劑，如0.1 M的碳酸氫铵，然後加水稀釋至理想濃度。含有遊離半胱氨酸的多肽應溶於(yú)脫氣的酸性緩沖液中，因爲當PH值大於(yú)7時，巯基會被迅速氧化成二硫化物。

如果整段肽電荷是零，說明肽是中性的。中性肽通常溶於(yú)有機溶劑。首先，嘗(cháng)試添加少量乙腈、甲醇或異丙醇。對於(yú)高度疏水的多肽，可使用少量的二甲基亞砜溶解，然後用水稀釋至理想濃度。對於(yú)含有自由半胱氨酸的肽，需使用DMF而不是DMSO。對於(yú)有聚集傾向的肽，可添加6M鹽酸胍或8M尿素，然後進行必要的稀釋。

爲瞭(le)防止或盡量減少多肽降解，請将多肽以凍幹粉形式保存在-20°C，-80°C更佳。如果需要保存溶液肽，分成小樣存放，以避免反複凍融。一份樣品融凍後未用完，應扔掉。細菌降解有時會成爲溶液肽的麻煩，所以請将肽溶於(yú)無菌水或肽溶液過濾除菌。

堿(jiǎn)性氨基酸: K, R, H, N-terminus

酸性氨基酸: D, E, C-terminus

極(jí)性中性氨基酸: F, I, L, M, V, W, Y

非極(jí)性疏水氨基酸: G, A, S, T, C, N, Q, P, 乙酰基，酰胺基

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