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大多肽在-20℃很穩定,特别是冷凍幹燥並保存在幹燥器中,在将它們暴露於空氣之前, 冷凍幹燥多肽可以放於室溫。這将是濕度影響減少,當無法冷凍幹燥時,最好的方法是以小的工作樣量存放。 對於含Cys, Met orTrP的多肽,脫氧緩沖劑對其溶解必不可少,因爲這種多肽可易空氣氧化, 在封瓶前,慢慢流過多肽的氮氣或氩氣也會降低氧化作用。含Gln或Asn的多肽也容易降解,所有這些肽與不含這些有問題解苷的那些肽相比,生命期有限。