多肽合成研究已經走過瞭一百多年的光輝曆程。1902年，Emil Fischer首先開始關注多肽合成，由於當時在多肽合成方面的知識太少，進展也相當緩慢，直到1932年，Max Bergmann等人開始使用苄氧羰基(Z)來保護α-氨基，多肽合成才開始有瞭一定的發展。

到瞭(le)20世紀50年代，有機化學家們合成瞭(le)大量的生物活性多肽，包括催産(chǎn)素，胰島素等，同時在多肽合成方法以及氨基酸保護基上面也取得瞭(le)不少成績，這爲後來的固相合成方法的出現提供瞭(le)實驗和理論基礎。

1963年，Merrifield首次提出瞭(le)固相多肽合成方法(SPPS)，這個在多肽化學上具有裏程碑意義的合成方法，一出現就由於其合成方便，迅速，成爲多肽合成的首選方法，而且帶來瞭(le)多肽有機合成上的一次革命，並(bìng)成爲瞭(le)一支獨立的學科——固相有機合成(SPOS)。因此，Merrifield榮獲瞭(le)1984年的諾貝爾化學獎。Merrifield經過瞭(le)反複的篩選，最終摒棄瞭(le)苄氧羰基(Z)在固相上的使用，首先将叔丁氧羰基(BOC)用於保護α-氨基並(bìng)在固相多肽合成上使用，同時，Merrifield在60年代末發明瞭(le)第一台多肽合成儀，並(bìng)首次合成生物蛋白酶，核糖核酸酶(124個氨基酸)。

1972年，Lou Carpino首先将9-芴甲氧羰基(FMOC)用於保護α-氨基，其在堿性條件下可以迅速脫除，10min就可以反應完全，而且由於其反應條件溫和，迅速得到廣泛使用，以BOC和FMOC這兩種方法爲基礎的各種肽自動合成儀也相繼出現和發展，並仍在不斷得到改造和完善。同時，固相合成樹脂，多肽縮合試劑以及氨基酸保護基，包括合成環肽的氨基酸正交保護上也取得瞭豐碩的成果。