FITC熒光标記多肽屬於FRET肽(Fluorescence resonance energy transfer, FRET)其中一種。FRET肽是研究肽酶特異性的便利工具，其反應過程容易連續監測，爲酶活性的檢測提供瞭一個便捷的方法。FRET肽生物學應用於:

1. 新的蛋白水解酶的篩選和檢(jiǎn)測(cè)。

2. 肽酶、蛋白酶、激酶、磷酸酶的動(dòng)力特征和功能特征。

3. 多肽折疊的構象研究。

FITC熒光标記應用廣泛，爲黃色結晶，zui大吸收光波長(zhǎng)爲490～495nm,zui大發射光波長(zhǎng)520～530nm，可呈現明亮的黃綠色熒光。FITC分子中含有異硫氰基與羧基熒光素相比更具活性，在堿性(pH9.0～9.5)條件下能與肽類或者蛋白的自由氨基結合，形成FITC-多肽/蛋白結合物，從(cóng)而制成熒光多肽/蛋白。

在固相多肽合成過程中，FITC可以與含有側(cè)鏈氨基的賴氨酸（Lys）、鳥氨酸（ornithine），或合成過程中的多肽N端氨基反應。當在N端标記時，建議在zui後一個氨基和FITC與氨基反應産(chǎn)生的硫脲鍵之間引入烷基間隔器（alkyl spacer），如氨基己酸（Ahx/Acp）。多肽兩種固相多肽合成方法(Fmoc和Boc策略合成法)zui終脫離樹脂程序，都要用到強酸TFA乃至更強的HF酸。如不引入氨基己酸（Ahx/Acp），氨基硫甲酰結構在強酸TFA中，極易進攻N末端*氨基酸的酰胺鍵，形成五元雜環(乙内酰硫脲衍生物)，從多肽或者蛋白上脫落。在TFA/H2O體系中乙内酰硫脲衍生物進一步形成結構穩定的乙内酰硫氨基酸。從而連同zui後一個氨基酸從多肽或者蛋白上脫落。

引入氨基己酸(Ahx/Acp)，可以有效的保護(hù)FITC熒光标記多肽的穩定性，保證後(hòu)續試驗的穩定。