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多肽是用來模拟蛋白的，爲瞭模仿蛋白的表現，我們需要合成與蛋白有相似的結構和電荷的多肽 。當一條肽段從一個蛋白中“切出”之後，兩端的電荷數将與基因體蛋白有差異。我們需要改變合成策略來使他們一緻。
總體而言：
如果是出自蛋白C端的序列，通過(guò)乙酰化将N端屏蔽；
如果是出自蛋白N端的序列，通過(guò)酰胺化将C端屏蔽；
如果是出自蛋白中間(jiān)部分，用乙酰化和酰胺化将兩(liǎng)端都屏蔽
