保存：
　　大多肽在-20℃很穩定，特别是冷凍幹燥並保存在幹燥器中，在将它們暴露於空氣之前， 冷凍幹燥多肽可以放於室溫。這将是濕度影響減少，當無法冷凍幹燥時，最好的方法是以小的工作樣量存放。 
　　對於含Cys, Met orTrP的多肽，脫氧緩沖劑對其溶解必不可少，因爲這種多肽可易空氣氧化， 在封瓶前，慢慢流過多肽的氮氣或氩氣也會降低氧化作用。含Gln或Asn的多肽也容易降解，所有這些肽與不含這些有問題解苷的那些肽相比，生命期有限。 
溶解性：
　　大多肽的道選溶劑是超純抽氣水。稀乙酸或氨水分别對於堿性或酸性多肽的溶解很重要。這些方法不溶的多肽， 需要DMF、脲、guanidiniam chloride或acetonitnle來溶解，這些溶劑可能某些實驗有副作用。所以我們建議設計多肽時要加注意。
　　殘基Ala, Cys , Ile, Leu, Met, Phe和Val将全增加多肽的溶解難度。