溶解多肽是非常複雜的事情，一般很難一下子確定合适的溶劑。通常是先取一點試驗，在沒有確定合适的溶劑前千萬不要合部溶解。 

下列方法有助於(yú)您選擇合适的溶劑(jì)：  

(1)判定多肽的電(diàn)荷特定，設定酸性氨基酸Asp(D),Glu(E)和C端COOH爲-1；堿性氨基酸Lys(K),Arg(R),His(H)及N端NH2爲+1,其它氨基酸的電(diàn)荷爲0。計(jì)算出将電(diàn)荷數。 

(2)如果淨電(diàn)荷數>0，多肽爲堿性，用水溶解：如果不溶解或溶解性不大，加入醋酸(10%以上)；如果多肽還不能溶解，加入少量TFA(25ul)溶解，然後(hòu)加入500ul水稀釋。  

(3)如果淨電(diàn)荷數<0，多肽爲酸性，用水溶解；如果不溶解或溶解性不大，加入氨水(25ul)溶解，然後(hòu)加入500ul水稀釋。  (4)如果淨電(diàn)荷數=0，多肽爲中性，一般需要用有機溶劑如乙腈，甲醇或異丙醇，DMSO等溶解。還有人建議需要尿素來溶解疏水性很大的多肽。